元气骑士的挑战因子系统为游戏带来了丰富的策略变化和可玩性深度，其核心机制在于通过参数控制生成不同难度组合的因子组，确保不会出现极端简单或困难的配置。随机生成的挑战因子会综合影响角色属性、敌人行为以及关卡环境，例如生命值固定为一点、伤害增减与攻速变化等效果，这些因子并非独立存在，而是通过相互制约或增强形成动态平衡。玩家需要理解因子之间的联动关系，才能在地牢探险中制定合理应对策略。
特定因子会显著改变战斗节奏和武器选择逻辑。攻速加倍攻击力减半的因子适合搭配高爆发蓄力武器如冰弓或群星弓，而伤害增加攻速减半则更适配慢速高伤近战武器。分裂因子会强制怪物在低血量时分裂，范围AOE武器如爆炸锤或雷暴锤能有效遏制分裂连锁反应。元素类武器在敌人负面效果减半的因子下会大幅削弱控制能力，这类情况需优先选择直接伤害型装备。
角色技能与因子的交互存在特殊规则。德鲁伊的狼宝宝、刺客的影子分身在禁止携带宠物及佣兵的因子下会失效，但工程师的炮台和机器人的机炮群仍可正常使用。圣骑士凭借高护盾值能有效抵消一血因子的负面效果，若配合蓝盾天赋甚至能承受瓦克恩首领的多段激光攻击。这类机制差异要求玩家根据当前因子组合灵活调整角色选择，而非固定采用单一角色应对所有情况。
警官处的挑战悬赏板每日自动刷新一次，首次完成后可消耗宝石进行最多15次手动刷新，但奖励每日仅能领取一次。特殊房间数量增加的因子会提升叹号房出现概率，这对需要频繁接触工匠的武器进阶玩法具有战略价值。玩家可通过离线修改系统时间的方式重置因子，但需注意可能触发宝石奖励领取异常的副作用。
高阶玩法需掌握因子与天赋的协同效应。暴击穿透与元素暴击天赋能弥补攻速减半因子的输出缺口，而各类防御盾天赋对密集敌人因子至关重要。纯粹试炼之地模式中，因子组合会进一步压缩容错空间，需要精确计算邪王水晶的宝石结算公式，通过击杀效率与波次控制来最大化收益。这类深度机制要求玩家建立完整的数值认知体系，而非仅依赖直觉判断。
